MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR56

Total Repeats: 244

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014028	CGA	2	6	8	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014028	TCGG	2	8	23	30	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014028	TC	3	6	34	39	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014028	GC	3	6	72	77	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014028	ACG	2	6	2854	2859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014028	ATG	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014028	GTT	2	6	2875	2880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014028	GCC	2	6	3536	3541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014028	T	8	8	3575	3582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014028	TCT	2	6	3586	3591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014028	ACT	2	6	3643	3648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014028	AAG	2	6	3649	3654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014028	GTA	2	6	3676	3681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014028	AAG	2	6	3684	3689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014028	AGA	2	6	3788	3793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014028	CT	3	6	3835	3840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014028	AG	3	6	3883	3888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014028	CTCC	2	8	3917	3924	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_014028	CTC	2	6	3942	3947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_014028	AGG	2	6	3997	4002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014028	AGC	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014028	GC	3	6	4161	4166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014028	CGA	2	6	4183	4188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014028	TGA	2	6	4192	4197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014028	ATT	2	6	4216	4221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014028	TTC	2	6	4229	4234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014028	TCT	2	6	4286	4291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014028	TCC	2	6	4312	4317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_014028	CT	3	6	4324	4329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014028	ACC	2	6	5295	5300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_014028	TC	3	6	5343	5348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014028	CTA	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014028	CTA	2	6	5446	5451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014028	GAA	2	6	5921	5926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014028	CAA	2	6	7987	7992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014028	AGTGG	2	10	8000	8009	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014028	AGA	2	6	8013	8018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014028	TGGC	2	8	9954	9961	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014028	CG	3	6	12186	12191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014028	CGG	2	6	17987	17992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014028	CCA	2	6	17997	18002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_014028	CTC	2	6	18078	18083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014028	CGC	2	6	18147	18152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_014028	TGC	2	6	18167	18172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014028	C	6	6	18188	18193	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_014028	GACC	2	8	18739	18746	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014028	C	6	6	18770	18775	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_014028	AG	3	6	18868	18873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014028	TCT	2	6	18885	18890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014028	TGC	2	6	18909	18914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014028	GA	3	6	18927	18932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014028	CCG	2	6	18945	18950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_014028	GA	3	6	18963	18968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014028	TCC	2	6	18997	19002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014028	GC	3	6	19004	19009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014028	CTC	2	6	19045	19050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014028	ACC	2	6	19091	19096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_014028	GCT	2	6	19125	19130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014028	ATCC	2	8	19131	19138	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014028	CTCA	2	8	19150	19157	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014028	CGT	2	6	19192	19197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014028	TC	3	6	20042	20047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014028	GCG	2	6	20075	20080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014028	TC	3	6	20088	20093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014028	ACA	2	6	20177	20182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014028	CTT	2	6	20219	20224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014028	CTT	2	6	20234	20239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014028	T	6	6	20253	20258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014028	ATAA	2	8	20267	20274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014028	A	7	7	20273	20279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014028	GTG	2	6	20325	20330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014028	GCC	2	6	20712	20717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_014028	CCT	2	6	20773	20778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_014028	TTC	2	6	20816	20821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014028	TGC	2	6	20898	20903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014028	TCG	2	6	20958	20963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014028	TTC	2	6	21002	21007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014028	TGG	2	6	21015	21020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014028	CTT	2	6	21088	21093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014028	TCC	2	6	21111	21116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_014028	ACC	2	6	21135	21140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_014028	CGG	2	6	21214	21219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014028	GCC	2	6	21237	21242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_014028	GTG	2	6	21359	21364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014028	GTCA	2	8	25404	25411	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014028	ATTC	2	8	25542	25549	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014028	CGA	2	6	25654	25659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014028	CGTT	2	8	25680	25687	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014028	T	6	6	28791	28796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014028	TGT	2	6	28856	28861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014028	C	6	6	28862	28867	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_014028	TCC	2	6	28869	28874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_014028	CAG	2	6	28897	28902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014028	CTT	2	6	28936	28941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014028	GCT	2	6	28958	28963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014028	AAG	3	9	29834	29842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014028	GGC	2	6	31430	31435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014028	GGC	2	6	32167	32172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014028	ACG	2	6	36687	36692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014028	AGC	2	6	39768	39773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014028	AAG	2	6	39782	39787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014028	GT	3	6	39910	39915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014028	TG	3	6	40833	40838	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014028	GT	3	6	40870	40875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014028	TAC	2	6	40886	40891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014028	GGC	2	6	40913	40918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014028	TTG	2	6	40954	40959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014028	GAA	2	6	41021	41026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014028	GACG	2	8	41051	41058	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014028	ATC	2	6	41063	41068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014028	GAG	2	6	41400	41405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014028	GAC	2	6	41409	41414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014028	A	6	6	41440	41445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014028	CGA	2	6	41447	41452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014028	GAG	2	6	41502	41507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014028	GTG	2	6	41529	41534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014028	ACG	2	6	41629	41634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014028	ACGTC	2	10	41647	41656	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_014028	A	6	6	42038	42043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014028	ACA	2	6	42059	42064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014028	CA	4	8	42099	42106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014028	GAA	2	6	43747	43752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014028	ATG	2	6	43787	43792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014028	GA	3	6	43805	43810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014028	TC	3	6	43859	43864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014028	GA	3	6	43985	43990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014028	AAT	2	6	44054	44059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014028	AAT	2	6	44063	44068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014028	ACA	2	6	44072	44077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014028	TA	3	6	44081	44086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014028	CCT	2	6	44124	44129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_014028	GAA	2	6	44162	44167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014028	GTC	2	6	44230	44235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014028	ACC	2	6	44279	44284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_014028	ATC	2	6	44319	44324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014028	TCC	2	6	44658	44663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_014028	TGCC	2	8	44665	44672	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014028	GGT	2	6	44716	44721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014028	TGGTG	2	10	44764	44773	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014028	AGA	2	6	44871	44876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014028	CGG	2	6	44955	44960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014028	CAC	2	6	45053	45058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_014028	GAC	2	6	45120	45125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014028	CT	3	6	45192	45197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014028	GAT	2	6	45254	45259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014028	GCA	2	6	45265	45270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_014028	GGA	2	6	45289	45294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014028	GAA	2	6	45380	45385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014028	CTT	2	6	45455	45460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014028	CGG	2	6	45461	45466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_014028	GAA	2	6	45544	45549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014028	TCA	2	6	45561	45566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014028	CGA	2	6	45599	45604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_014028	GCC	2	6	45762	45767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_014028	GAC	2	6	45865	45870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_014028	AAG	2	6	45908	45913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014028	GCA	2	6	45964	45969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_014028	GCA	2	6	46000	46005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_014028	GAA	2	6	46061	46066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_014028	CCG	2	6	47007	47012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_014028	A	9	9	47062	47070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014028	CTGGA	2	10	47106	47115	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
165	NC_014028	GAC	2	6	47364	47369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_014028	TGA	2	6	47630	47635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014028	CT	3	6	47636	47641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
168	NC_014028	TC	4	8	47652	47659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
169	NC_014028	ATCG	2	8	47674	47681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_014028	AGA	2	6	47708	47713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014028	CAC	2	6	47755	47760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_014028	CGAC	2	8	47783	47790	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
173	NC_014028	TCC	2	6	47829	47834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_014028	CATC	2	8	47891	47898	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
175	NC_014028	CCTC	2	8	48074	48081	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
176	NC_014028	ACC	2	6	48085	48090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
177	NC_014028	CCTTGA	2	12	48129	48140	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_014028	GACC	2	8	48158	48165	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
179	NC_014028	CGCGG	2	10	48241	48250	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
180	NC_014028	AC	3	6	51517	51522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
181	NC_014028	ACGGT	2	10	53567	53576	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
182	NC_014028	TCG	2	6	53674	53679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_014028	GAC	2	6	53696	53701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_014028	ATA	2	6	53758	53763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_014028	GCC	2	6	53832	53837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
186	NC_014028	TGCC	2	8	53864	53871	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
187	NC_014028	CTT	2	6	53881	53886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_014028	ATC	2	6	53962	53967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_014028	GAG	2	6	53980	53985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_014028	AG	3	6	54142	54147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
193	NC_014028	AGG	2	6	54203	54208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_014028	CGCAG	2	10	54327	54336	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
198	NC_014028	TC	3	6	54366	54371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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233	NC_014028	CGA	2	6	55599	55604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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239	NC_014028	AG	3	6	55984	55989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_014028	GA	3	6	56222	56227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
243	NC_014028	GGC	2	6	56241	56246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.